A Missão Evangélica Caiuá atua na área de prestação de serviço e ações complementares na área de atenção à saúde, visando o atingimento dos objetivos específicos estabelecidos pela Secretaria Especial e Saúde Indígena (SESAI) em consonância com a política Nacional de Atenção à Saúde dos Povos Indígenas (PNASPI) e as especificidades sócio-culturais dos povos indígenas , no âmbito do Subsistema de Atenção à Saúde Indígena (SASISUS) através de convênio firmado com a Fundação Nacional de Saúde (FUNASA), desde o ano 2000. Atualmente a entidade é responsável pela gestão de 09 (nove) convênios nos estados de Acre, Amazonas, Mato Grosso do Sul e Roraima.